Agytumorból származó fehérjék kvantitatív meghatározása tömegspektrometriás módszerrel

A rákos megbetegedések napjainkban a kardiovaszkuláris kórképek mellett az egyik leggyakoribb halálokot jelentik a világ legtöbb országában. Az agytumoroknak jellemzően két típusra különíthetők el. A primer agydaganatok (gliómák) invazívak, ezért kezelésük nagyon nehéz, a teljes gyógyulás nagyon ritka. Ezzel szemben a rosszindulatú nem agyi daganatok agyi áttétei az agyállományban jól körülírtak maradnak, sebészileg az esetek többségében gond nélkül eltávolíthatók.
Munkánk során a DE-OEC Idegsebészeti klinika Neuro-onkológiai Laboratóriumából kapott, különböző agydaganatokból származó minták meghatározott fehérjéinek koncentrációját kívántuk meghatározni, ezáltal világosabb képet alkotni a tumorok nagyfokú invazivitásbeli különbségéről.
A sebészeti úton eltávolított daganatos szöveteket lizáltuk, a fehérjéket acetonos kicsapás segítségével tisztítottuk, majd tripszines emésztés után speciális tömegspektrometriás módszerrel határoztuk meg a fehérje koncentrációkat. Az MRM (multiple reaction monitoring) a tripla kvadrupóllal rendelkező tömegspektrométerek sajátos mérési módszere, amikor a kvadrupólok úgy vannak beállítva, hogy az első kvadrupól csak a megfelelő anyaiont, a hármadik pedig csak a megfelelő fragmens iont engedi át, a második pedig ütközési cellaként szolgál. A megfelelő értékek, ún. MRM átmenetek beállítása révén lehetővé válik csak a meghatározott anyagok specifikus detektálása. A kapott jel görbe alatti területe pedig arányos a tömegspektrométerbe bejuttatott fehérje koncentrációjával. A kívánt MRM átmenetek megtervezése és a módszer optimalizálása után 23 fehérje mennyiségét határoztuk meg a különböző típusú agydaganatokban.